La humedad provoca muchas de las alteraciones consideradas más peligrosas que sufre este tipo de manifestaciones artísticas. 

Puede estar originada por numerosos motivos, siendo las más comunes la humedad por capilaridad, condensación e infiltración. Así pues, la aparición de eflorescencias salinas en la capa pictórica debido al empuje de las sales solubles o la pérdida de adhesividad de las capas constitutivas con el consiguiente movimiento de las mismas, obliga a tomar soluciones urgentes para evitar un deterioro grave en los enlucidos.

Por otro lado la contaminación ambiental afecta negativamente a la capa pictórica, modificando el aspecto cromático y debilitando la estabilidad de los materiales debido a reacciones químicas.

Actualmente está causando estragos en todo el patrimonio mundial en mayor medida y en comparación con cualquier otro agente de degradación de la historia de los tiempos.

Las suciedades superficiales, manchas, repintes, las expansiones térmicas y mecánicas debidas a choques por el movimiento de la estructura son parte del resto de alteraciones habituales en la pintura mural cuyo hándicap más común es encontrarse en lugares de dificil accesibilidad en muchas ocasiones.